В России разработали «навигатор по геному» для борьбы с раком толстой кишки
Новинка может помочь в создании более эффективных средств для противодействия недугу.
Специалисты Центрального университета разработали «навигатор по геному», предназначенный для борьбы с раком толстой кишки. По сути, это вычислительный метод, который в течение нескольких часов позволяет обнаружить гены, которые вредоносные клетки используют для своего роста.
По словам специалистов, разработка способна стать важным шагом к созданию более эффективных лекарств от колоректального рака, одной из ключевых причин онкологической смертности в мире.
Новый метод объединяет три независимых типа биологических данных, описывающих происхождение и природу опухоли: физические контакты между длинной некодирующей РНК и ДНК, метки активности генов и расположение так называемых суперэнхансеров. Анализируя эти сигналы, алгоритм обнаруживает участки ДНК, которые могут стать потенциально уязвимыми для болезни.
Применив алгоритм к данным клеток колоректального рака, учёные получили короткий список из 12 перспективных генов-мишеней вместо тысяч возможных вариантов. Активность всех этих генов повышена в опухолях пациентов по сравнению со здоровой тканью.
